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蛋白質(zhì)印跡法中為什么檢測(cè)不到目的蛋白?

發(fā)布時(shí)間:2021-04-26瀏覽次數(shù):1081返回列表

很多小伙伴在對(duì)膠片印跡進(jìn)行短暫曝光后,檢測(cè)不到目的蛋白。可從以下幾個(gè)方面來(lái)優(yōu)化實(shí)驗(yàn)步驟:

1、裂解物制備

每道全細(xì)胞提取物的 20–30 ?g 總蛋白,通常足夠用來(lái)檢測(cè)。如果靶標(biāo)蛋白的基礎(chǔ)水平,或蛋白質(zhì)修飾程度低,可能需要通過(guò)化學(xué)刺激劑來(lái)誘導(dǎo)表達(dá)或修飾。你可能要調(diào)查備選細(xì)胞系或組織,其所含的目的蛋白含量geng高。應(yīng)將樣品溶解于適當(dāng)?shù)木彌_液中,該緩沖液包含蛋白酶抑制劑和針對(duì)磷酸化目標(biāo)的磷酸酶抑制劑。應(yīng)務(wù)必對(duì)裂解物進(jìn)行超聲處理,以確保有效的染色質(zhì)和膜結(jié)合靶標(biāo)的蛋白質(zhì)提取。請(qǐng)查看我們網(wǎng)站上的對(duì)照物表,獲得推薦的陽(yáng)性對(duì)照物和處理方法。

2、一抗稀釋和/或孵育

使用推薦的封閉劑(5% BSA 或 5% 脫脂奶粉),以推薦的稀釋度溶解于 TBST 中,在 4°C 下,過(guò)夜孵育一抗。使用備選封閉劑,如明膠、血清、無(wú)蛋白封閉劑、酪蛋白、或混合封閉劑,可能降低靶標(biāo)信號(hào)強(qiáng)度。如需單個(gè)抗體的優(yōu)化結(jié)果,請(qǐng)查詢(xún)產(chǎn)品數(shù)據(jù)表找到推薦的稀釋緩沖液。

3、SDS-PAGE 凝膠選擇

一般來(lái)說(shuō),推薦采用 Tris-Glycine 凝膠。但是,對(duì)于高分子量蛋白質(zhì),我們推薦采用 Tris-Acetate 凝膠和相關(guān)緩沖液。蛋白質(zhì)從 1 毫米凝膠轉(zhuǎn)移比從 1.5 毫米凝膠轉(zhuǎn)移geng有效。使用geng厚的凝膠,可能會(huì)導(dǎo)致高分子量蛋白質(zhì)的轉(zhuǎn)移不完全,所以我們推薦監(jiān)測(cè)轉(zhuǎn)移效率,根據(jù)目的靶標(biāo)蛋白質(zhì)分子量大小,優(yōu)化轉(zhuǎn)移條件。

4、轉(zhuǎn)移和膜

可通過(guò)延長(zhǎng)轉(zhuǎn)移時(shí)間或使用geng高的電壓,可改善轉(zhuǎn)膜不完全。一般來(lái)說(shuō),我們建議在轉(zhuǎn)移緩沖液中加入 20% 甲醇,然后在 70 V 電壓下進(jìn)行為時(shí) 2 小時(shí)的濕轉(zhuǎn)。對(duì)于高分子量蛋白質(zhì),我們建議減少轉(zhuǎn)移緩沖液中的甲醇至 5%,以提高轉(zhuǎn)移效率并避免大分子蛋白質(zhì)在凝膠基質(zhì)中固定,并且在 70 V 電壓下延長(zhǎng)轉(zhuǎn)移時(shí)間至 3 小時(shí)。檢測(cè)較小的蛋白質(zhì)時(shí),可能在轉(zhuǎn)膜期間出現(xiàn)過(guò)度轉(zhuǎn)移(過(guò)膜蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)移)問(wèn)題。對(duì)于小蛋白質(zhì)分子,使用孔隙大小為 0.2 ?m 的膜并在 70 V 電壓下進(jìn)行為時(shí) 1.5 小時(shí)的濕轉(zhuǎn),而不是使用孔隙大小為 0.45 ?m 的膜或進(jìn)行過(guò)夜轉(zhuǎn)移,這樣做很重要,因?yàn)楹笳呖赡軙?huì)導(dǎo)致過(guò)度轉(zhuǎn)移和丟失小蛋白質(zhì)分子信號(hào)。

5、封閉

膜封閉時(shí)間過(guò)長(zhǎng)可能會(huì)掩蓋抗原表位,并阻止抗體結(jié)合。在室溫下僅封閉 1 小時(shí)。

6、洗滌

洗滌時(shí)間超過(guò)推薦的三次 5 分鐘是一個(gè)常見(jiàn)問(wèn)題,可能會(huì)導(dǎo)致減少信號(hào)。我們推薦計(jì)時(shí)洗滌,以確保準(zhǔn)確性。TBST 應(yīng)包含 0.1% Tween? 20。這適用于一抗和二抗孵育后的洗滌步驟。此外,我們建議在 TBST 中洗滌,因?yàn)橐延袛?shù)據(jù)顯示在 PBST 中洗滌會(huì)導(dǎo)致減少信號(hào)。

7、二抗稀釋和/或孵育

可用相同的細(xì)胞提取物和一抗在印跡上進(jìn)行二抗的梯度稀釋?zhuān)詢(xún)?yōu)化二抗?jié)舛?。?wù)必在室溫下,在含 5% 脫脂奶粉的 TBST 中孵育二抗 1 小時(shí)。避免在 HRP-偶聯(lián)二抗的緩沖液中加入疊氮hua鈉,因?yàn)榀B氮化物會(huì)抑制 HRP 的活性。

8、檢測(cè)試劑

采用能用抗-生物素-HRP 進(jìn)行檢測(cè)的生物素化分子量標(biāo)準(zhǔn)作為化學(xué)發(fā)光檢測(cè)的陽(yáng)性對(duì)照物