一、本質不同：

間接的酶標抗體是二抗，與待檢抗體結合；阻斷酶標抗體是一抗，與抗原結合。間接中底物降解的量與抗體量相等，阻斷底物降解量與抗體。

二、實驗結果不同：

酶聯免疫吸附試驗 (以下簡稱ELISA) ：是酶免疫測定技術中應用廣的技術，其基本方法是將已知的抗原或抗體吸附在固相載體 ( 聚苯乙烯微量反應板 ) 表面，使酶標記的抗原抗體反應在固相表面進行，用洗滌法將液相中的游離成分洗除，常用的ELISA法有雙抗體夾心法和間接法。

OD值不同是因為前后樣液的濃度不同，所以透光率也不一樣，但是前后的OD值都是表示同一種物質在不同濃度時的OD值，只是相對在0.2-0.8范圍內比較而已。

三、用途不同：

ELISA為簡便實用和標準化,從而使其成為廣泛應用的檢測方法之一，目前ELISA方法已被廣泛應用于多種細菌和病毒等疾病的診斷，在動物檢疫方面，ELISA在豬傳染性胃腸炎、牛副結核病、牛傳染性鼻氣管炎、豬偽狂犬病、藍舌病等的診斷中已為廣泛采用的標準方法。

用于標記的酶 用于標記抗體或抗抗體的酶須具有下列特性：有高度的活性和敏感性；在室溫下穩(wěn)定；反應產物易于顯現；能商品化生產。目前應用較多的有辣根過氧化物酶（HRP）、堿性磷酸酶、葡萄糖氧化酶等，其中以HRP應用廣。